Analyses RNAseq d'échantillons de poissons

Type de prestations

Réalisation du séquençage haut débit (RNAseq) à partir d'ARN extraits d'organes ou de globules blancs de poissons.
Possibilité de modalités de préparation des bibliothèques mentionnées (par ex. poly-A ou ribodéplétion selon typologie des échantillons).

Caractéristiques techniques des échantillons et contrôles

Quantité minimale d'ARN exigée : 300 ng, mesurée par fluorimétrie et spectrométrie.
Mesure de l'intégrité (RiN/RIN) effectuée sur un panel représentatif d'extraits.
Contrôles qualité (QC) et rapports associés fournis pour chaque lot incluant métriques de profondeur et de qualité de séquençage.

Logistique, traçabilité et stockage

Réception d'échantillons transmis par transporteur spécialisé sous conditionnement réfrigéré.
Stockage des échantillons à -20 °C minimum pendant au moins six mois après réception (possibilité de proposer stockage plus long).
Stockage des données brutes de séquençage (fichiers fastq.gz) au moins six mois après leur mise à disposition.
Exigence de traçabilité : identifiants d'échantillons reflétés dans les noms de fichiers fastq.gz ; enregistrement des manipulations et démarches d'assurance qualité.

Livrables et communication

Mise à disposition des données de séquençage au laboratoire destinataire (transfert de données) et envoi d'un accusé de réception du lot.
Notification préalable à l'autorité contractante en cas de difficulté technique, pénurie de consommables ou fermeture (prévenir 1 mois avant toute fermeture programmée) ; possibilité d'annulation en cas de non-respect des délais contractuels.
Documentation des méthodes, procédures de traçabilité et possibilité de contrôle des habilitations techniques et des traitements appliqués.

Tous les détails du marché

Gagnez du temps, toutes les infos des documents sont déjà analysées: cahier des charges, infos clés, budget, contact, etc

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