Exploration des interactions de la protéine RARA en leucémie aiguë promyélocytaire
Prestations techniques
Description générale
- Réalisation d'analyses expérimentales et bioinformatiques visant à détecter, caractériser et interpréter les interactions de la protéine RARA avec des partenaires (ex. SKI, GATA2) et l'impact fonctionnel de mutants informatifs.
Analyses protéomiques et biologie moléculaire
- Préparation, contrôle qualité et gestion des échantillons biologiques.
- Analyse protéomique à haute sensibilité pour identification d’interacteurs (purifications, spectrométrie de masse, contrôle des contaminants).
- Analyse ciblée des mutants de RARA, SKI et GATA2 pour déterminer effets sur interactions et stabilité.
Imagerie cellulaire et colocalisation
- Expérimentations d’imagerie (immunofluorescence, imagerie quantitative, techniques de co-localisation, DUO-Link, FRAP ou équivalentes) pour valider interactions et localisation subcellulaire.
Analyses transcriptomiques et bioinformatique
- Réalisation et analyse d’études transcriptionnelles (RNA‑Seq) incluant, si nécessaire, analyses single‑cell.
- Analyses bioinformatiques associées : alignement, quantification, analyses de differential expression, intégration protéine‑ARN, contrôle qualité des jeux de données.
Traitement des données et qualité
- Traitement des données brutes, contrôle qualité systématique, filtrage et élimination des contaminants et artefacts.
- Fourniture des jeux de données traités selon standards reproductibles et documentation des pipelines analytiques.
Livrables et rédaction scientifique
- Rédaction d’un rapport scientifique détaillé décrivant la nature des interactions RARA/SKI/GATA2, leurs conséquences moléculaires et interprétations biologiques, avec données annexes et éléments exploitables pour publication.
Profil et organisation opérationnelle
- Équipe dotée d’un savoir‑faire avancé en protéine‑biologie, biologie moléculaire, imagerie cellulaire quantitative et analyses bioinformatiques. Capacité d’autonomie protocolaires, de restitution claire des résultats et de remplacement de personnel par profils équivalents si nécessaire.
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Critères d'évaluation
| Pondération | Critère |
|---|---|
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