Bio-informatique pour diagnostic moléculaire par NGS

Développement et déploiement d'un pipeline bio-informatique

Conception, développement et documentation d'un pipeline spécifique pour l'analyse de données NGS issues de fichiers FASTQ.
Développement et validation pour 4 panels distincts ; rédaction de rapports de validation, publication des métriques de performance et fourniture des jeux de données de validation.
Critères de validation incluant métriques de couverture (ex. 30X, 50X, 100X) et tests de non-interférence humaine.
Intégration et validation en interaction avec les fournisseurs d'instrumentation selon besoins (tests V&V).

Traitement des données et résultats

Analyse automatisée et reproductible des données brutes jusqu'à génération de résultats interprétables.
Production de rapports détaillés de sortie (métriques, QC, variantes détectées) et des livrables de vérification (logs, traces, rapports de tests).

Sécurité, infrastructure et gestion des données

Mise à disposition d'une interface sécurisée pour le transfert des données et la consultation des résultats (authentification, chiffrement, journalisation, ségrégation des données).
Documentation complète de l'infrastructure technique (serveurs, stockage, systèmes d'exploitation, configurations logicielles) et des mesures de sécurité.
Stockage sécurisé des données brutes et des résultats avec politiques de rétention et de propriété des données (prévoir conservation minimale spécifiée par le donneur d'ordre).
Conformité RGPD requise et respect des exigences de sécurité associées.

Qualité, accréditation et accompagnement

Accompagnement vers l'accréditation (ISO 15189 et recommandations COFRAC/ANPGM) : production de plans qualité, matrice RACI, procédures, et assistance lors d'audits.
Fourniture de rapports, preuves de validation et assistance documentaire pour les processus qualité.

Support, formation et maintenance

Mise à disposition d'un support opérationnel et d'un service d'administration (SLA à définir), propositions de PCA/PRA et exigence de continuité de service.
Formation initiale et mises à jour annuelles des utilisateurs sans coût additionnel.
Preuves de compétence du personnel : organigramme, fiches de poste et qualifications à fournir.

Modalités complémentaires

Prestation modulable : certaines prestations optionnelles peuvent être demandées via devis et descriptif technique.
Possibilité de fournir une version d'évaluation du logiciel pour essais et démonstrations.

Tous les détails du marché

Gagnez du temps, toutes les infos des documents sont déjà analysées: cahier des charges, infos clés, budget, contact, etc

Marchés similaires