Plateforme de séquençage génomique short-read

Vue générale

Fourniture, livraison, installation, mise en service et exploitation d'une solution intégrée de séquençage short‑read couvrant l'intégralité du workflow: extraction d'acides nucléiques, préparation automatisée de librairies, séquençage, réactifs et consommables associés.
Solution homogène en une seule fourniture (pas d'allotissement) et évolutive vers d'autres applications (RNA‑Seq, méthylome, exomes, panels, ADN circulant).

Extracteur d'acides nucléiques

Extraction ADN (sang total frais et congelé) et options ARN / ADN circulant.
Capacité opérationnelle compatible avec ~20 000 échantillons/an; traitement en plateaux 96; volumes 200 µL à 2000 µL; maintien possible à +4 °C; décontamination UV.
Gestion de tubes/racks (1,5 mL, 2 mL, racks 48–96), lecture codes‑barres 2D, traçabilité automatisée, import/export de données et protocoles préprogrammés.
Exigence de qualité d'ADN (DIN > 7) et déploiement/programmes par le fournisseur.

Robot préparateur de librairie

Automatisation complète de la préparation de librairies NGS, détection de niveaux de liquide, évolutivité pour nouveaux protocoles.
Chargement automatisé des consommables, possibilité de têtes de pipetage additionnelles, lecture codes‑barres et connexion au SGL.
Détail des coûts optionnels exigé (tête de pipetage, poste informatique, développement/transfert de protocole, formation pour 5 personnes).

Séquenceur short‑read

Capacité à produire ~20 000 génomes humains entiers/an en WGS 30x.
Exigences de qualité: Q30 minimal (80 % des lectures) et gestion des runs, planification, stockage des données de run.
Possibilités d'extension fonctionnelle (RNA‑Seq, méthylome, panels, ADN circulant) et fourniture optionnelle de pipelines bioinformatiques.

Documentation, maintenance et formation

Fourniture d'un dossier technique complet: mémoire technique, notices, manuels de maintenance, croquis d'installation, protocoles, contraintes environnementales.
Prestations de maintenance pour l'ensemble des équipements; mises à jour système/OS; formation initiale et session(s) additionnelles chiffrées.
Simulation transparente et vérifiable du coût de fonctionnement basée sur 20 000 WGS/an, intégrant réactifs et consommables.

Logistique et déploiement

Conditionnement, livraison et déchargement conformes aux exigences hospitalières; livraison et déploiement coordonnés avec services biomédicaux; reprise éventuelle d'emballages.

Exigences contractuelles et administratives

Remise d'un mémoire technique et des cadres de réponse technique et développement durable ; présentation des données et chiffrages sur lignes séparées dans l'annexe financière.

Tous les détails du marché

Gagnez du temps, toutes les infos des documents sont déjà analysées: cahier des charges, infos clés, budget, contact, etc

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