Plateforme d’immunofluorescence multiplexe automatisée

Fourniture d’un équipement automatisé d’immunofluorescence multiplexe permettant l’analyse spatiale de biomarqueurs protéiques et ARN sur tissus, avec conservation de l’architecture tissulaire. Le workflow assure, sans intervention entre les cycles, le staining, l’acquisition, l’élution et le restaining, ainsi que l’export standardisé des données.

Les exigences minimales comprennent 10 plex pour les protéines, 12 cibles ARN, 20 cycles automatisés et la détection simultanée d’au moins 2 marqueurs par cycle. Le besoin vise aussi des panels hyperplex de plus de 20 marqueurs.

Échantillons, imagerie et traitement des données

• Compatibilité requise avec les tissus FFPE, frozen/fixed frozen et les lames histologiques standard de 75 × 25 mm ; les tissus frais congelés sont souhaitables. Épaisseur de coupe prise en charge : 4 µm.
• Staining avec anticorps primaires non conjugués, sans technologie nécessitant un barcoding complexe, compatible avec des anticorps commerciaux standards et préservant les épitopes après des cycles successifs. La technologie microfluidique doit assurer homogénéité, faible consommation de réactifs et reproductibilité élevée.
• Microscope intégré, objectif 40×, résolution ≤ 0,28 µm/pixel, fluorophores compatibles DAPI, FITC/Cy2, TRITC/Cy3, Cy5 et Cy7 ; stitching et alignement automatiques.
• Logiciels de pilotage et de visualisation, contrôle qualité de l’image, génération automatique de protocoles et de panels, compatibilité avec l’intelligence artificielle et l’analyse spatiale, ainsi qu’avec HALO, QuPath, Visiopharm et HORIZON™. Sorties TIFF, export multicanal et métadonnées complètes.
• Capacité annoncée : 4 lames par run. Le cahier des charges indique un temps de run 40-plex supérieur à 24 h et un temps moyen par cycle (4 lames) de 60 h / 40 marqueurs.

Installation, formation et qualification

Le titulaire installe et met en service l’équipement sous sa responsabilité dans les 7 jours calendaires suivant la date contractuelle de livraison. Il réalise la qualification opérationnelle : vérification de conformité aux spécifications, du fonctionnement, de l’installation et de la configuration des modules, avec acquisitions sur des échantillons représentatifs des conditions normales du laboratoire et vérification des résultats au regard des performances attendues.

Un rapport de vérification d’aptitude est remis dans les 30 jours calendaires suivant cette vérification. Si elle est positive, le pouvoir adjudicateur dispose de 4 semaines pour la vérification du service régulier ; à l’issue de cette période, le CRSA dispose de 10 jours ouvrés pour notifier sa décision. La propriété est transférée à la date de l’admission définitive.

Le titulaire fournit la documentation technique en français ou en anglais, les procédures d’utilisation et de maintenance primaire, ainsi que les protocoles de validation et guides de transfert d’essais. Les documents sont mis à jour après les modifications matérielles ou logicielles. L’offre inclut un cahier des charges et un planning d’entretien, de révisions et de contrôles obligatoires. Une formation théorique et technique à l’équipement et au logiciel est prévue pour un effectif estimatif de 6 personnes ; son volume et le nombre de bénéficiaires sont précisés dans l’offre, les dates étant convenues avec l’Inserm.

Maintenance et consommables

La maintenance est assurée pendant la garantie ; à son issue, le titulaire doit assurer la maintenance préventive et curative. La préventive comprend les visites sur site, la calibration, le remplacement des pièces et les mises à jour logicielles. La curative couvre les pannes liées à un défaut matériel ou de fabrication, l’assistance technique à distance pendant les heures ouvrées et, si nécessaire, le retour en atelier.

Les consommables nécessaires au fonctionnement sont fournis pendant toute la durée du marché, au fil des bons de commande :

• puces à usage unique pour coloration et imagerie multiplexées, tampons d’élution-L, de multimarquage, de trempe-L et d’image, et kit de nettoyage fluidique ;
• anticorps secondaires de chèvre anti-souris IgG conjugué Alexa Fluor™ Plus 555 (1 mg, 2 mg/ml), anti-souris IgG (H+L) conjugué Alexa Fluor™ Plus 647, anti-IgG de lapin conjugué Alexa Fluor™ Plus 647 (1 mg, 2 mg/ml) et anti-lapin IgG conjugué Alexa Fluor™ Plus 555.

Les prérequis indiqués comprennent un laboratoire L2 minimum, une alimentation électrique stabilisée, un accès réseau sécurisé, un stockage de données haute capacité, un serveur de stockage d’images et une sauvegarde automatisée ; un GPU est recommandé pour les analyses IA sur HALO.