Caractérisation d'anticorps monoclonal par HDX-MS

Pré-analyse et contrôles qualité

• Vérification de la qualité et de la compatibilité des échantillons.
• Cartographie peptidique préliminaire (digestion protéolytique et identification des peptides observables).
• Contrôles de traçabilité et de conformité des échantillons à l'entrée.

Expérimentation HDX-MS

• Expériences d'échange hydrogène/deutérium comparant antigène libre et complexe anticorps–antigène.
• Séries de temps multiples d'incorporation du deutérium couvrant plusieurs fenêtres cinétiques.
• Réplicats techniques pour assurer reproductibilité et évaluation statistique des variations d'uptake.
• Optimisation des conditions expérimentales : choix et optimisation de la digestion protéolytique, optimisation de la couverture peptidique et maintien de la stabilité du complexe pendant l'essai.

Traitement des données et raffinement IA

• Traitement des spectres HDX-MS, quantification des profils d'incorporation du deutérium par peptide.
• Analyse comparative statistique des différences d'uptake entre états libre et lié.
• Raffinement des cartographies via algorithmes d'intelligence artificielle/bioinformatique structurale pour soutenir l'interprétation des épitopes conformationnels et linéaires.

Livrables et restitution scientifique

• Rapports PDF contenant : cartographie peptidique identifiée, profils d'incorporation du deutérium, graphiques comparatifs d'uptake, identification des régions d'interaction (épitope et paratope), représentations structurales du complexe et interprétation scientifique.
• Fourniture d'éléments graphiques exploitables (figures, tableaux de données) et explication méthodologique des analyses.
• Support scientifique et échange technique final pour restitution des résultats.

Garanties et confidentialité

• Respect d'un accord de confidentialité (NDA).
• Obligation d'alerter en cas de problème analytique et de garantir la confidentialité et l'intégrité des données et des résultats.
• Transfert des droits d'utilisation des résultats selon les conditions prévues.