Structuration d’une filière de valorisation de l’arbousier

Le lot comprend une première caractérisation génotypique destinée à rechercher des marqueurs SSR spécifiques, puis, si les résultats de cette tranche ferme sont validés, le génotypage de 72 échantillons et la caractérisation de la diversité.

Tranche ferme — 6 à 7 échantillons

• Pré-étude bibliographique au laboratoire, choix des marqueurs à tester, conception et synthèse des amorces.
• Préparation des échantillons, extraction, dosage et normalisation des ADN ; conservation au laboratoire selon la demande du client ; génotypage et analyse des données brutes pour évaluer la faisabilité de la suite.
• Le CCTP indique 2 à 3 feuilles par échantillon dans la description de l’objet, mais « 23 feuilles par échantillon » dans la description de la mission : les indications sont discordantes.

Tranche optionnelle — 72 échantillons
Sous réserve de validation de la présence de marqueurs spécifiques lors de la tranche ferme : réception et préparation au laboratoire de feuilles prélevées et identifiées par le porteur de projet, extraction et préparation des ADN, puis génotypage avec les marqueurs SSR utilisés au laboratoire. L’analyse comprend notamment la recherche de doublons, le calcul d’un indice de diversité et une synthèse ; un appui à la valorisation des résultats (figure, poster, bilan) est prévu.

Un rapport technique décrivant la méthodologie et les conclusions est attendu. Les prélèvements transmis proviennent du secteur d’étude du Parc et du périmètre d’intervention de l’ASL Suberaie Varoise.