Fourniture d’équipements de transcriptomique spatiale

Fourniture d’un équipement autonome permettant l’analyse non biaisée de l’ensemble du transcriptome sur coupes de tissus frais ou fixés, notamment FFPE, avec une résolution d’au moins 5 µm.

L’offre doit documenter les performances de l’équipement, des échantillons et réactifs, ainsi que les accessoires, logiciels, garanties, maintenance, livraison et éléments environnementaux.

• Surface maximale d’acquisition par lame, résolution spatiale, sensibilité en UMI par spot et en gènes détectés par cellule
• Reproductibilité inter-run, temps de prétraitement, nombre de lames par cycle et compatibilités FFPE, tissus congelés, autres fixateurs, organoïdes, cellules et TMA
• Épaisseur de coupe supportée, caractère propriétaire ou non des lames et possibilité d’analyses complémentaires après le cycle, notamment histologie, IF, multiplex ou IMC
• Poste informatique, logiciels d’acquisition, d’analyse, de visualisation et de contrôle qualité, mises à jour, évolutivité et compatibilité avec les solutions de séquençage

Le kit de démarrage doit permettre la vérification du fonctionnement, la mise en route et la formation des utilisateurs, avec une expérimentation allant de la préparation de l’échantillon à la préparation des librairies. Le fournisseur doit fournir la liste complète des consommables, leurs quantités et leurs coûts.

La formation concerne environ cinq personnes, sur site et en présentiel, pendant au moins une journée par équipement. Elle intervient dans le mois suivant l’installation et couvre la prise en main, la maintenance, la préparation des échantillons, les protocoles, les workflows et l’analyse des données ; une attestation est remise à chaque participant.

La garantie est incompressible de trois ans, pièces et main-d’œuvre. La PSE obligatoire ajoute deux années et comprend les déplacements, pièces, main-d’œuvre et maintenances préventives et correctives. Une visite préventive annuelle au minimum est exigée ; l’intervention à distance doit intervenir sous deux jours ouvrés et l’intervention sur site sous cinq jours ouvrés selon les conditions prévues. Les pièces, réactifs, mises à jour et maintenance doivent être disponibles pendant au moins cinq ans.

Les documents papier et PDF, en français et/ou en anglais, comprennent les notices d’utilisation, procédures d’installation et de réglage, dispositifs de sécurité, maintenance et contacts fournisseurs. La livraison, l’installation et la mise en ordre de marche sont réalisées sous quatre mois. L’équipement est livré au laboratoire RMeS à Nantes, avec accès par rampe et monte-charge de 1 200 kg, puis doit être déplacé et réinstallé dans un autre bâtiment nantais en 2030, recalibration éventuelle comprise.