Tri et identification des macro-invertébrés benthiques

La prestation porte sur le tri, la détermination taxonomique et le dénombrement de macro-invertébrés benthiques, par prélèvement et par tamis. Le corpus annoncé comprend 425 prélèvements issus de trois campagnes menées de mai à septembre 2018 sur 30 stations (certaines stations étaient encore sous la neige lors de la première campagne), auxquels s’ajoutent 55 prélèvements du torrent de Taconnaz, collectés à cinq reprises entre septembre 2019 et septembre 2021. Le total décrit est donc de 480 prélèvements.

Chaque prélèvement est séparé en trois fractions avec une colonne de tamis de 2 mm, 500 µm et 250 µm. Chaque tamis est nettoyé séparément par balnéation afin d’extraire les particules fines sans endommager les invertébrés. La méthode prévoit de remuer le tamis dans une cuvette remplie d’eau au maximum aux trois quarts et de reverser les éléments passés dans l’eau vers le tamis suivant. L’opération est répétée jusqu’à séparation exhaustive ; le jet d’eau ne doit jamais être dirigé directement sur l’échantillon. Pour le tamis de 250 µm, la matière recueillie dans la bassine est jetée.

Tri, sous-échantillonnage et détermination

Le tri et l’identification se font séparément pour chacun des trois tamis. Le sous-échantillonnage n’est autorisé que pour les taxons dépassant leur seuil, et non pour l’échantillon entier. Les minima ci-dessous s’appliquent par taxon et par tamis ; après estimation de l’abondance totale, les genres sont répartis au prorata. Le niveau de détermination demandé est celui de l’annexe taxonomique du cahier des clauses.

| Taxon | Niveau de tri et minimum d’individus |
|---|---|
| Ephemeroptera | Genre : 150 |
| Plecoptera — Leuctridae, Leuctra | Genre : 40 |
| Plecoptera — autres | Genre : 60 |
| Trichoptera — Limnephilidae | Sous-famille : 50 |
| Trichoptera — autres ; Coleoptera — autres | Genre : 50 |
| Diptera — Chironomidae | Famille : 100 |
| Diptera — Simuliidae | Famille : 30 |
| Diptera — Ceratopogonidae | Sous-famille : 30 |
| Diptera — Limoniidae | Genre/sous-famille : 40 |
| Diptera — Empididae | Sous-famille : 30 |
| Diptera — autres | Famille : 50 |
| Odonata ; Hemiptera | Genre : 50 |
| Amphipoda — Gammaridae | Genre : 100 |
| Amphipoda — autres ; Isopoda — Asellidae et autres | Genre : 50 |
| Copepoda ; Ostracoda ; Cladocera | Ordre : 50 |
| Mollusca | Genre : 50 |
| Achaeta ; Triclades | Genre : 40 |
| Nematoda | Ordre : 10 |
| Hydracarina | Ordre : 20 |
| Oligochaeta | Ordre : 30 |

Les individus sont identifiés et dénombrés par taxon, stade (larve, adulte, pupe ou indéterminé) et tamis. Ils sont conditionnés par taxon et par tamis dans des tubes Eppendorf Safe-Lock de 1,5 mL, en éthanol à 96 % non dénaturé. Chaque tube porte le code station, le numéro de prélèvement, la date, le numéro de tamis et le nom du taxon. Les tubes sont regroupés dans des contenants étanches étiquetés par station, date et catégorie : Ephemeroptera, Plecoptera, Trichoptera ou Autres.

Restitution, données et suivi

Les prélèvements triés sont restitués dans leurs boîtes d’origine, avec le refus de tri et, le cas échéant, les individus issus du refus de sous-échantillonnage, conservés dans de l’éthanol à 96 %. Aucune matière ne doit être jetée : l’intégralité du contenu initial doit être restituée pour les analyses ultérieures. Les contenants plastiques d’origine représentent 30 caisses de 60 × 40 × 32 cm. Le candidat décrit dans son offre les modalités de retrait des prélèvements et de retour des livrables.

Les livrables comprennent les prélèvements triés, les tubes étiquetés et regroupés, ainsi qu’une liste faunistique indiquant taxons, stades et abondances par tamis. Les données et métadonnées (dont taille de tamis, code échantillon et identificateur) sont saisies dans le fichier Excel fourni. Le DQE indique, à titre purement indicatif et sans engagement de l’acheteur, 500 unités pour chacune des lignes tri, identification, pilulisation et saisie des listes faunistiques, ainsi que 2 quantités de frais associés ; ces quantités sont distinctes du total de 480 prélèvements décrit pour le corpus.

L’offre précise le nombre de personnes affectées, leurs qualifications, l’organisation visant à homogénéiser la résolution taxonomique et à limiter le biais opérateur, ainsi que le temps moyen estimé par prélèvement. Le titulaire est responsable des éléments qui lui sont confiés et ne peut les utiliser qu’aux fins du marché. Le remplacement d’un intervenant est soumis à l’approbation de l’acheteur et doit intervenir dans les cinq jours suivant la demande ou la proposition. Le contrôle des quantités d’échantillons est prévu sous une semaine ; les vérifications sont prévues dans un délai maximal d’un mois. Ces délais comportent une exception pour juillet et août et peuvent être allongés selon les périodes de congés.