Fourniture d’un système d'analyse transcriptomique spatiale à haute résolution

CNRS
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Date limite8 août 2025 à 14 h
LocalisationMarseille (13)
Durée
4 mois maximum à compter de la date de notification
Budget
Non précisé

Détails des prestations techniques demandées

  1. Introduction et description générale
    Cet appel d'offres concerne l'acquisition d’un système d'analyse transcriptomique spatiale à haute résolution permettant l'identification et la quantification des ARN messagers à l'échelle de la cellule unique, tout en préservant l'information spatiale dans des coupes de tissus.
    Les performances attendues incluent :
    • Détection et quantification simultanée de centaines de transcrits d'ARN.
    • Préservation de l'information spatiale des cellules.
    • Compatibilité avec les échantillons fixés et inclus en paraffine (FFPE).
    • Intégration de données d'immunofluorescence ou d'histologie.
    • Réutilisation du tissu pour d'autres analyses.

  1. Spécifications techniques de l’équipement

    • Composants matériels :
      • Analyseur in situ automatisé, microscope à fluorescence, platine automatisée, système fluidique, etc.
      • Station de travail informatique haute performance avec des spécifications précises (CPU, RAM, stockage, etc.).
    • Exigences physiques :
      • Dimensions maximales compatibles avec un laboratoire standard, poids, alimentation électrique, etc.
    • Compatibilité des échantillons :
      • Analyse de tissus FFPE et congelés, taille et épaisseur des échantillons.

  2. Pipeline de prétraitement des données

    • Logiciel d’acquisition et de traitement pour le contrôle de l'instrument, acquisition d'images, prétraitement des données, etc.
    • Processus de prétraitement incluant correction d'images, identification des transcrits, segmentation cellulaire, et contrôle de qualité.

  3. Analyse des données

    • Outils d’analyse intégrés pour le clustering, identification des types cellulaires, analyses d'expression différentielle, etc.
    • Visualisation interactive des données, superposition des données transcriptomiques sur des images histologiques, et exportation de figures.

  4. Modalités d’exécution des prestations du service après-vente et garantie

    • Garantie de cinq ans couvrant le remplacement des pièces, main d'œuvre, et assistance technique.
    • Engagements de qualité de service en cas de panne.
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Critères d'évaluation

PondérationCritère
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Échantillons

Requis

Adresse de livraison

CNRS Délégation Provence et Corse, SFAC – Pôle Achats et Opérations Immobilières, Bâtiment PH – Bureau 301, 31 Chemin Joseph Aiguier, CS 70071, 13402 Marseille Cedex

Modalités de livraison

Les échantillons doivent être emballés et étiquetés conformément aux règlements et normes en vigueur. Les inscriptions sur les emballages doivent être en français. Les fournitures doivent répondre aux exigences de conformité réglementaire de l’Union Européenne et doivent être marquées "CE".

Produits à fournir

  • Tissus FFPE
    xsections jusqu'à 18 mm x 18 mm, épaisseur entre 5 et 10 μm
  • Tissus congelés
    xsections jusqu'à 18 mm x 18 mm, épaisseur entre 5 et 10 μm

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