Prestations de séquençage pour VetAgro Sup

Les prestations techniques demandées dans le cadre de cet appel d'offre incluent les éléments suivants :

• Séquençage d'ARN : Analyse des séquences d'ARN pour diverses applications.
• Séquençage d'ADN type SANGER : Méthode classique de séquençage d'ADN.
• Séquençage de génome complet : Réalisé sur des échantillons d'E. coli et de mammifères, incluant l'assemblage et l'annotation des génomes.
• Séquençage de produits de PCR : Identification précise d'un pathogène ou d'un génotype, ou confirmation de résultats.
• Purification du produit de PCR : Lorsque mélangé à d'autres, pour obtenir un produit d'intérêt.
• Identification d'une souche bactérienne : Par identification moléculaire via séquençage de gène, par exemple pour la listeria monocytogenes.
• Génotypage : Comprenant la migration de PCR marquée et purification, de type MLVA.
• Assemblage des séquences et consensus : Réalisé par des méthodes comme MLST.
• Analyse des profils de génotypage : Pour des études de diversité génétique.
• Analyses bioinformatiques : Comprenant l'extraction d'ADN génomique sur colonies.