Réalisation d'analyses ADN d'échantillons de bois et de sols forestiers

Analyse de l’ADN Fongique

• Réaliser une analyse de l’ADN fongique selon une méthode de métabarcoding environnemental.
• Effectuer un contrôle de la présence d’ADN fongique séquençable et, si nécessaire, réaliser une réextraction des ADN ou une optimisation de la PCR.
• Livrer les résultats sous format Excel.

Prélèvement et Envoi des Échantillons

• Les échantillons sont prélevés par les agents des Parcs selon un protocole spécifique.
• Les échantillons doivent être homogénéisés et conservés à -20°C jusqu’à l’envoi au laboratoire.

Réalisation des Analyses

• Analyser 206 échantillons, incluant des blancs environnementaux pour chaque jour d’analyse.
• Procéder à des analyses ADN de 66 échantillons de litière et sols, et 140 échantillons d’arbres vivants et morts.
• Effectuer des contrôles qualité, amplification par PCR, séquençage, et analyses bio-informatiques.

Livrables

• Un compte rendu synthétique de la campagne d’analyse, incluant le protocole d’analyse et une synthèse des résultats.
• Un tableur Excel par site avec des données spécifiques sur les échantillons analysés.