Fourniture de réactifs de séquençage NGS et prestations de bio-informatique associées

CHU de Clermont-Ferrand
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Date limite26 septembre 2025 à 10 h
LocalisationClermont-Ferrand (63)
Durée
12 mois à compter de la date de notification, reconductible 3 fois
Budget
Non précisé

Prestations techniques demandées pour le Lot 1 : Cytogénétique : Analyse par NGS pour la recherche de mutations TP53

Le marché a pour objet la fourniture de réactifs de séquençage NGS et des prestations de bio-informatique associées pour le laboratoire du C.H.U. de Clermont-Ferrand. Les prestations techniques comprennent :

  1. Fourniture de réactifs et analyse :
    • Bundle de réactifs et analyse pour 96 échantillons.
    • Stratégies d'indexage (UMI, UDI, etc.).
    • Quantité d'ADN nécessaire : environ 200 ng.
    • Région d'intérêt : Exon 2 à 11 + épissage (+/- 50-100 pb autour de la zone d’épissage).
    • Compatibilité avec les séquenceurs Illumina.
    • Sensibilité de 1% pour une couverture de 1000X.
    • Détection des variants et événements rares (SNV, CNVs, fusions, etc.).
    • Accès à tous les fichiers d’analyses intermédiaires et liste complète des variants détectés.
    • Rapport personnalisable pour chaque échantillon.
    • Traçabilité des outils bio-informatiques utilisés.
    • Certificat de non-régression à chaque mise à jour des logiciels.
    • Sécurité des données (cryptage, RGPD).

  1. Formations utilisateurs et référents :

    • Organisation et contenu de la formation pour les utilisateurs du système analytique.
    • Notice d’utilisation fournie en version papier et numérique.

  2. Accompagnement à l’accréditation :

    • Validation et vérification des méthodes.
    • Outils d’aide à l’accréditation (méthodologie, logiciels, bibliographie).
    • Prise en charge des coûts associés aux validations de méthodes.

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Critères d'évaluation

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Échantillons

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