Extraction d'ADN à partir de tiques collectées

Réception et stockage des échantillons

• Réception des tubes Eppendorf contenant des tiques ou du sang conservés dans l'alcool.
• Registre des échantillons sous forme de tableur avec identifiants uniques.
• Stockage à -20 °C; possibilité de stockage à 4 °C avant extraction selon instructions.

Pré-traitement des tiques

• Élimination de l'éthanol.
• Lavage dans deux bains successifs de 5 minutes avec eau milliQ.
• Séchage sur papier absorbant.
• Transfert dans tubes de lyse (NucleoSpin Bead Tube Type D ou Lysing Matrix S selon protocole).
• Inclusion systématique d'un témoin négatif d'extraction par série.

Extraction d'ADN

• Mise en œuvre de kits commerciaux selon protocoles fabricants.
• Kits acceptés : NucleoSpin DNA Insect (méthode dédiée) et NucleoSpin Tissue (méthode dédiée).
• Pour l'extraction à partir de sang, utilisation exclusive du kit NucleoSpin Tissue et de la méthode associée.

Contrôle qualité et quantification

• Contrôle qualité inclus pour chaque série d'extraction (à décrire dans l'offre).
• Quantification des ADN extraits pour vérification du rendement et homogénéisation des concentrations pour analyses ultérieures.

Stockage, transfert et format des livrables

• ADN extraits identifiés et stockés à -20 °C jusqu'envoi en colis froid vers le laboratoire partenaire.
• Transmission d'un fichier de résultats exploitable (tableur ou équivalent) accompagnant chaque envoi.

Livrables et traçabilité

• Rapports intermédiaires annuels décrivant méthodologie, résultats et fichiers de contrôle qualité (format exploitable).
• Rapport final de synthèse quantitative et critique en PDF.
• Documentation complète de traçabilité (identifiants d'échantillon, paramètres opératoires, témoins, courbes/mesures sur demande).

Conformité

• Respect strict des protocoles fournis par les fabricants des kits sélectionnés.
• Intégration des contrôles de qualité et conservation des archives et fichiers de traçabilité.