Fourniture d’équipements scientifiques de laboratoire et d’une solution bathymétrique par drone

Fourniture, installation et mise en service de trois équipements destinés à la recherche en biologie moléculaire : un thermocycleur qPCR, un instrument automatisé d’analyse des acides nucléiques et un séquenceur nanopore. Les équipements doivent être livrés au Technopôle de Mayotte, avec essais, documentation et logiciels nécessaires.

Thermocycleur qPCR

Système de PCR en temps réel pour quantifier ADN et ARN à partir d’échantillons biologiques, avec détection optique de fluorescence.

• Format 96 puits, compatible avec plaques 96 puits, tubes PCR individuels, SYBR Green et sondes TaqMan ; détection multiplex sur 4 ou 5 canaux.
• Plage de température de 4 °C à 99 °C ; précision de température ± 0,1 °C et uniformité du bloc ± 0,2 °C.
• Logiciel dédié avec quantification relative et absolue, calcul des seuils CT et courbes de fusion ; écran tactile, port USB et compatibilité réseau pour transférer ou sauvegarder les résultats.

Analyse automatisée de la qualité des acides nucléiques

Instrument de type TapeStation 4150 ou équivalent, utilisant l’électrophorèse sur micropuces ScreenTape. Il prend en charge l’ADN génomique, l’ADNc, l’ARN total, l’ARNm et les protéines.

• 16 échantillons par passage, jusqu’à 96 échantillons par session avec micropuces ScreenTape.
• Évaluation qualitative et quantitative : concentration, intégrité (RIN, DIN) et profil de taille ; sensibilité adaptée aux faibles concentrations.
• Logiciel produisant rapports, courbes d’électrophorèse, pics et profils de migration ; export CSV ou PDF, port USB et compatibilité réseau. Écran tactile ou PC dédié et possibilité d’automatiser les analyses répétitives.

Séquençage nanopore

Instrument GridION Project Pack ou équivalent pour le séquençage à haut débit de l’ADN et de l’ARN, avec lecture directe en temps réel de molécules longues, sans amplification préalable.

• Jusqu’à cinq flow-cells utilisées simultanément ; débit cumulatif annoncé jusqu’à 150 Gb par run selon les flow-cells et les conditions expérimentales ; compatibilité R9.4.1 ou versions ultérieures.
• Précision minimale de 98 à 99 % après correction par kits ou protocoles d’amélioration ; analyse possible de modifications telles que les méthylations.
• Logiciel de contrôle et d’analyse avec suivi en temps réel, basecalling, assemblage, alignement, annotation et export FASTQ, BAM et VCF. Système comprenant un ordinateur, des ports Ethernet et un stockage extensible ou sauvegardable ; fourniture initiale de flow-cells, de kits de préparation de librairies, câbles et adaptateurs nécessaires.

Les opérations de livraison, d’installation, de paramétrage et de mise en service incluent la vérification du fonctionnement et des tests de conformité aux performances attendues. Garantie minimale de 12 mois à compter de l’admission définitive, couvrant pièces, main-d’œuvre et déplacement, avec assistance technique sur demande. La maintenance pendant la garantie inclut le remplacement de pièces, l’assistance à distance sous 48 heures et, si nécessaire, une intervention sur site sous 7 jours calendaires ; les mises à jour logicielles applicables et les transports aller-retour liés aux pannes couvertes sont pris en charge. Une extension de garantie d’au moins 12 mois est proposée en prestation supplémentaire éventuelle.