Criblage d'imagerie à haut débit sur modèles placentaires et évaluation antivirale
Fiche synthétique du marché public. Analyse détaillée et points essentiels du DCE.
Imagerie à haut débit et modèles biologiques
Objectifs principaux
- Développer et optimiser des protocoles d'imagerie automatisée pour la détection d'infection par Flavivirus (principalement Zika ; possible extension à Usutu, West Nile, Dengue) sur modèles cellulaires et explants placentaires ex vivo.
Modèles et niveaux de biosécurité
- Travail en niveaux de manipulation L2 et L3.
- Modèles cellulaires : lignées HIPEC et JAR (incluant comparaison JAR WT vs JAR C19MC-KO).
- Explants placentaires humains pour analyses ex vivo.
Techniques d'imagerie et analyses automatisées
- Utilisation de microscopie à haut débit en mode confocal et/ou Light Sheet pour acquisition d'images quantitatives.
- Pipelines d'analyse automatisée pour : dénombrement cellulaire, quantification de l'accumulation de protéines virales et extraction de métriques robustes par image.
- Validation technologique par comparaison de permissivité virale entre JAR WT et JAR KO.
Criblage, étalonnage et évaluations fonctionnelles
- Calibration des conditions de criblage en utilisant l'inhibiteur de référence 7DAM comme témoin positif d'inhibition de la réplication virale.
- Mesures automatisées de l'activité antivirale ou provirale des vésicules extracellulaires (EV) issues de cellules JAR WT/KO, incluant l'évaluation de l'activité provirale liée à la présence d'ARN sfRNA.
- Qualification et caractérisation des EV préparées et fournies par l'équipe coordinatrice (contrôle qualité des lots avant criblage).
Logistique des échantillons et contraintes opérationnelles
- Réception et mise en culture/infection des explants placentaires préparés par l'équipe coordinatrice ; transport sous la responsabilité de l'exécutant.
- Délai de viabilité biologique des explants : 1 heure entre retrait et mise en culture/infection ; organisation horaire à convenir.
Livrables attendus
- Rapports de progression après chaque expérience (remise sous 10 jours calendaires maximum).
- Fourniture complète des données : accès aux images brutes et jeux de données quantitatives et métadonnées sous formats exploitables pour l'acheteur.
Contraintes complémentaires liées à l'exécution
- L'infection des modèles est réalisée par l'équipe exécutante selon les conditions définies.
- Respect des bonnes pratiques de traçabilité des échantillons et des exigences de biosécurité applicables.
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Gagnez du temps, toutes les infos des documents sont déjà analysées: cahier des charges, infos clés, budget, contact, etc
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Critères d'évaluation
| Pondération | Critère |
|---|---|
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Échantillons
Adresse de livraison
Explants préparés par l'équipe coordinatrice (UMR1291 / site de préparation communiqué par l'acheteur)
Modalités de livraison
Transport assuré par l'exécutant depuis le site de préparation jusqu'au site d'exécution ; heures et jour de collecte à convenir ; délai de viabilité biologique 1 heure entre retrait et mise en culture/infection.
Produits à fournir
- Explants placentaires humains préparés
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