Animation scientifique et suivi biologique agroforestier

Université de Toulouse
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Date limite
21 août 2026 à 12 h
Localisation
Pyrénées (31, 65, 64 et Huesca)
Durée
30 mois
Budget
Non précisé

Suivi biologique, analyses moléculaires et diagnostic

Objectifs

  • Assurer le suivi biologique, pédologique et moléculaire des sites pilotes : prélèvements, analyses, analyses statistiques et alimentation d'une base de données mutualisée.

Tâches principales

  • Réaliser prélèvements de sols et racines représentatifs en champ, conditionner et acheminer les échantillons pour analyses externes si nécessaire.
  • Préparer échantillons pour analyses moléculaires haut‑débit et coordonner les envois vers plateformes d'analyse.
  • Mettre en place et assurer un suivi biologique pluriannuel des aménagements, participer à l'évaluation des effets des aménagements.
  • Réaliser analyses pédologiques, analyses statistiques (analyses de réseaux mycéliens, corrélations avec variables pédoclimatiques/biologiques) notamment sous R.
  • Constituer, alimenter et livrer incrémentations régulières d'une base de données scientifique mutualisée avec métadonnées associées.
  • Co‑construire une méthodologie de prélèvement et une grille de diagnostic des sites, et rédiger comptes‑rendus et synthèses.

Livrables attendus

  • Échantillons conditionnés prêts pour séquençage et produits/analytes prêts pour plateformes.
  • Comptes‑rendus intermédiaires et finaux d'analyses moléculaires et pédologiques.
  • Incrémentations régulières et structurées de la base de données avec métadonnées.
  • Rapports d'analyses statistiques et synthèses; grille de diagnostic co‑construite.

Contraintes et modalités

  • Suivi pluriannuel avec exigences de prélèvements représentatifs et méthodes standardisées pour préparation d'échantillons pour séquençage haut‑débit.
  • Logistique d'acheminement et conditionnement des échantillons intégrée au forfait (frais et responsabilité incluses).

Compétences requises

  • Maîtrise des prélèvements en champ, préparation d'échantillons pour séquençage haut‑débit, analyses pédologiques, analyses statistiques avancées sous R et étude de réseaux mycéliens ; capacités de gestion et d'alimentation d'une base de données scientifique.

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