Analyses multi-omics de profils protéomiques et métabolomiques d'îlots pancréatiques

Métabolomique non ciblée (optionnelle)

• Protocoles d'extraction compatibles avec la protéomique si nécessaire.
• Analyse LC‑MS/HRMS pour annotation non ciblée avec utilisation de banques (HMDB, METLIN, KEGG) et standards internes.

Contrôle qualité et traçabilité

• Plan de gestion de la qualité documenté: QC par série, tests de reproductibilité inter‑séries, matrices d'abondance normalisées.
• Traçabilité des opérations analytiques et des fichiers de métadonnées associés.

Bioinformatique et livrables de données

• Prétraitement, normalisation et annotation des jeux de données.
• Fourniture de fichiers bruts et traités dans des formats ouverts (CSV, mzML, etc.), tables d'abondance normalisées et fichiers de métadonnées compatibles pour intégration multi‑omics.

Phasage et validation

• Phase pilote de faisabilité sur un sous‑ensemble pour validation des workflows et critères QC avec rapport de décision go/no‑go avant la phase opérationnelle.
• Phase opérationnelle d'analyse complète suivant protocole validé avec livrables méthodologiques et registres de traçabilité.

Gouvernance, communication et sous‑traitance

• Désignation d'un responsable scientifique/technique, reporting régulier et réunions de suivi.
• Sous‑traitance possible sous conditions d'agrément et responsabilité continue du titulaire.

Sécurité des données et conformité

• Mesures de protection des données et conformité RGPD pour le traitement des données et des métadonnées.