Prélèvements et analyses d’eau pour inventorier les espèces de poissons

Dans le cadre de l’inventaire des poissons par ADN environnemental, les prestations à réaliser sont les suivantes :

• Préparation et mise en œuvre des campagnes d’échantillonnage :

  • Échantillonnage de la matrice eau pour analyses ADNe selon les recommandations.
  • Mesures in situ nécessaires identifiées dans les recommandations.

• Analyse en laboratoire de l’ADNe :

  • Dresser une liste des espèces de poissons pour chaque site de mesure.
  • Analyse critique du protocole de mesure et des listes d’espèces obtenues.

• Transmission des données :

  • Format adapté pour intégration dans les systèmes d’information nationaux dédiés à l’ADNe.

• Rapports :

  • Rédaction et fourniture d’un rapport de terrain et d’un rapport de synthèse final dans les délais précisés.

• Réunions :

  • Participation aux réunions définies pour le suivi de la prestation.

Conditions d’exécution

• Espèces ciblées :

  • Comprend les chondrichtyens, actinoptérygiens et agnates dans le milieu marin côtier ou estuarien.
  • Forte attente concernant la détection d’espèces rares et sensibles.

• Sites d’échantillonnage :

  • Huit sites répartis sur la façade Artois-Picardie, dont quatre dans des ports et quatre dans des estuaires.

• Prélèvement de l’eau :

  • Réalisé en automne 2025, entre le 15 septembre et le 15 novembre.
  • Échantillonnage exhaustif selon la nature du site, avec des consignes précises pour éviter la contamination.

• Analyse des échantillons :

  • Identifier plusieurs espèces par approche multispécifique ou metabarcoding de l’ADN.
  • Optimisation des protocoles pour maximiser les rendements en ADN.

• Bancarisation des données :

  • Mise à disposition des données dans le respect de la loi sur l'open data.

• Interprétation et discussion des résultats :

  • Analyse des listes d’espèces obtenues et recommandations méthodologiques.

Restitution des prestations et livrables

• Au lancement de la prestation :

  • Réunion de présentation de la stratégie d’échantillonnage.

• À l’issue de l’échantillonnage :

  • Compte-rendu des opérations et rapport de terrain détaillant les conditions de prélèvement.

• Fin de prestation :

  • Rapport final comprenant la méthodologie, la bancarisation des données, et une analyse critique des résultats.

• Livrables attendus :

  • Couche SIG des tracés de prélèvement, fichier listant les espèces de poissons, rapport final, etc.